В результате экспериментов получилось вот такое размещение фреймов для гимпа. Использовалась одна из фич ionа — плавающие границы фреймов. При наведении курсора на полоску слева или снизу фрейм открывается полностью (http://omploader.org/vNDloMA). В левом размещено окно со слоями, в нижний вылезают все окна, кроме, собственно, изображения.
Почему не скретчпады? При работе в гимпе все-таки большинство действий совершается манипулятором, а не клавиатурой, потому быстрее навести его на фрейм, чем давить нужные кнопки.

А еще тут можно обнаружить страшные желтые буквы. Это такая замена статусбару. Вылезает она по хоткею, висит на экране 3 секунды. Очень хочется, чтобы они висели только тогда, когда кнопка нажата, и пропадали при отпускании ее. Но средств для этого я не нашел.

Остальные окошки почти видны в окнах гимпа. urxvt, firefox с vimperator и глобальным css, psi (решил использовать ее из-за адекватной поддержки gpg, в отличии от ткаббера).